Từ năm 2007 - 2009: Lm phó xứ Hoà Bình
Từ năm 2009 - 2013: Lm phó xứ Tuyên Quang
Từ năm 2013 - 07/2020: Lm quản xứ Hàm Yên
Từ 07/2020 - 06/2024: Lm quản xứ Tân Quang
Từ 06/2024 - nay: Lm chính xứ Phi Đình
Vào lúc 19g00 ngày 28.3.2026, tại nhà thờ Giáo xứ Trù Mật, cha xứ Giuse Nguyễn Văn Yêm đã chủ tế Thánh lễ Lá, khai mạc Tuần Thánh – tưởng niệm mầu nhiệm Vượt Qua của Chúa Kitô. Đồng tế có cha Antôn Phan Thanh Đồng, cha Giuse Bùi Công Dũng và cha Giuse Đỗ Văn Thành.
